KEGG Annotation

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Je un ensemble de gènes (séquences d'acides aminés). Je veux trouver les annotations fonctionnelles basées Kegg ou ids KO. Y at-il base de données KEGG disponible en téléchargement? Je veux utiliser cette base de données avec explosion. De plus, je cherchais paquet R qui peut me aider à cet égard.

Je l'espère, je l'ai clarifié ma requête. Merci pour votre réponse à l'avance.

Créé 19/09/2018 à 12:59
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1 réponses

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base de données KEGG d'abonnement requis:

https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html

Liste de prix:

https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf

Si vous restez intéressé est ici la liste des données disponibles:

https://www.kegg.jp/kegg/download/

séquences FASTA sont ici:

https://www.kegg.jp/kegg/download/Readme/README.fasta

Créé 19/09/2018 à 13:30
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